Hamilton về nhất trong một trận đua đáng ghi nhớ dưới trời mưa tầm tã tại Nhật bản. Vì Alonso bỏ cuộc nên khả năng vô địch thế giới của tay đua trẻ này đã tăng cao hơn bao giờ hết.

Thời tiết tại Fuji Speedeway không ủng hộ đoàn đua F-1. Dưới trời mưa tầm tã, các phi công đã không thể khởi hành theo cách thông thường mà buộc phải xếp hàng sau Safety Car suốt 18 vòng(!) liền. Ngay lúc này, Ferrari đã đánh mất khả năng giành chiến thắng sau khi chọn loại lốp intermediate – loại lốp dùng được cho cả trời mưa lẫn trời nắng – cho xe đua của họ và bởi không thể phóng trên sân ngập nước bằng những chiếc lốp này nên Massa và Raikkonen buộc phải vào box thay lốp ngay ở những vòng đầu tiên. Quay lại sân đua, do Safety Car đang ở trong sân nên hai chiếc Ferrari đành phải xếp cuối cùng vì không được quyền vượt các xe khác. Nhờ đó Lewis Hamilton và Fernando Alonso hoàn toàn yên tâm khi Safety Car rời sân để cuộc đua chính thức khai màn ở vòng thứ 18. Sau hàng loạt va chạm và nhiều tình tiết đầy kịch tính, ở vòng thứ 42, Alonso đã húc vào tường rào chắn và đành bỏ dở cuộc đua. Nhờ đó, Hamilton có thể bình tâm về nhất, bỏ cách Kovalainen (Renault) một khoảng khá “an toàn”. Kimi Raikkonen dù đã cố gắng hết sức nhưng chỉ về thứ ba. Lão tướng David Coulthard (Red Bull) về thứ 4, vượt lên trên Fisichella (Renault). Massa tấn công mãnh liệt Kubica ở vòng cuối cùng, hai chiếc xe đua nhiều lần đã chạm vào nhau và phần thắng thuộc về Ferrari. Tonio Luizzi về thứ 8, giành một điểm duy nhất cho Toro Rosso nhưng chưa kịp ăn mừng thì đã nhận được tin ban trọng tài quyết định phạt anh 25 giây vì tội vượt Adrian Sutil (Spyker) ở vòng thứ 55 khi cờ vàng đang được phất lên. Vì thế, Sutil được chính thức công nhận là về đích ở vị trí thứ 8, dành 1 điểm quý báu cho Spyker.

Sau trận đua này, Hamilton có 107 điểm hơn Alonso tới 12 điểm và tiếp tục kéo dài khoảng cách với hai tay đua Ferrari (Raikkonen giành 90 điểm và Massa giành 80 điểm). Còn hai trận đua nữa là mùa giải năm nay kết thúc nên khả năng Hamilton vô địch là rất lớn bởi anh chỉ cần khôn khéo duy trì lợi thế là đủ.